| Transcriptome dynamics of cork oak (Quercus suber) somatic embryogenesis reveals active gene players in transcriptome regulation and phytohormone homeostasis of embryo development |
2019 |
Capote, T.; Usié, A.; Barbosa P.; Ramos, A.M.; Morais-Cecílio, L.; Gonçalves, S |
Article d'investigació |
| Chip-Seq reveals that QsMYB1 directly targets genes involved in ligning and subering biosynthesis pathways in cork oak (Quercus suber) |
2018 |
Capote, T.; Barbosa, P.; Usié, A.; Ramos, A.M.; Inácio, V.; Ordás, R.; Gonçalves, S. ; Morais-Cecílio, L. |
Article d'investigació |
| The draft genome sequence of cork oak |
2018 |
Ramos , A.M.; Usié, A.; Barbosa, P.; Barros, P.M.; Capote, T.; Chaves, I.; Simões, F.; Abreu, I.; Carrasquinho, I.; Faro, C.; Guimarães, J.B.; Mendonça, D.; Nóbrega, F.; Rodrigues, L.; Saibo, N.; Vare |
Article d'investigació |
| Characterization of the cork formation and production transcriptome in Quercus cerris × suber hybrids |
2018 |
Meireles, B.; Usié, A.; Barbosa, P.; Fortes, A.M.; Folgado, A.; Chaves, I.; Carrasquinho, I.; Costa, R.L.; Gonçalves, S.; Teixeira, R.T.; Ramos, A.M.; Nóbrega, F. |
Article d'investigació |
| Comprehensive Analysis of the Cork Oak (Quercus suber) Transcriptome Involved in the Regulation of Bud Sprouting |
2017 |
Usié, A.; Simões, F.; Barbosa, P.; Meireles, B.; Chaves, I.; Gonçalves, S.; Folgado, A.; Almeida, M.H.; Matos, J.; Ramos, A.M. |
Article d'investigació |
| Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain |
2017 |
Barbosa, P.; Leão, C.; Usié, A.; Amaro, A.; Botelho, A.; Pinto, C.; Inácio, J.; Stevenson, K.; Ramos, A.M. |
Article d'investigació |
| Expression Profiling in Pinus Pinaster in Response to Infection with the Pine Wood Nematode Bursaphelenchus xylophilus |
2017 |
D. Gaspar; C. Trinidade; A. Usié; B. Meireles; P. Barbosa; A. Fortes; C. Pesquita; R. Costa; A.M. Ramos |
Article d'investigació |
| CheNER: a tool for the identification of chemical entities and their classes in biomedical literature |
2015 |
Usié A.; Cruz J.; Comas J.; Solsona F.; Alves R. |
Article d'investigació |
| The CHEMDNER corpus of chemicals and drugs and its annotation principles |
2015 |
Krallinger M, Rabal O, Leitner F, Vazquez M, Salgado D, Lu Z, Leaman R, Lu Y, Ji D, Lowe DM, Sayle RA, Batista-Navarro RT, Rak R, Huber T, Rocktäschel T, Matos S, Campos D, Tang B, Xu H, Munkhdalai T, |
Article d'investigació |
| Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools |
2014 |
Jordi Vilaplana; Francesc Solsona; Ivan Teixido; Anabel Usié; Hiren Karathia; Rui Alves; Jordi Mateo |
Article d'investigació |
| CheNER: Chemical Named Entity Recognizer |
2014 |
Usie, A.; Alves, R.; Solsona, F.; Vazquez, M.; Valencia, A. |
Article d'investigació |
| Biblio-MetReS for user-friendly mining of genes and biological processes in scientific documents |
2014 |
Usie A, Karathia H, Teixidó I, Alves R, Solsona F. |
Article d'investigació |
| Biblio-MetReS: A bibliometric network reconstruction application and server |
2011 |
Usie A.; Karathia H.; Teixido I.; Valls J.; Faus X.; Alves R.; Solsona F. |
Article d'investigació |
| Methods for and results from the study of design principles in molecular systems |
2011 |
Salvado B.; Karathia H.; Chimenos AU.; Vilaprinyo E.; Omholt S.; Sorribas A.; Alves R. |
Article d'investigació |
| Modelo de asignación de tareas en entornos multicluster heterogéneos y no dedicados |
2009 |
Blanco, H.; Lérida, JL; Guirado, F; Usié, AI. |
Capítol de llibre d'investigació |
